En Profondeur est publié en collaboration avec Québec Subaquatique depuis plus de 40 ans, à raison de trois numéros par année. Ce magazine se veut un moyen de communication accessible à l’ensemble de la communauté des plongeurs du Québec, ainsi qu’à toute personne ou tout organisme dont la nouvelle est en affinité avec la mission d’En Profondeur. Son contenu se structure autour de quelques grands thèmes : les activités subaquatiques, l’actualité, les voyages, de nombreux conseils techniques, de sécurité et de santé ainsi qu’un volet environnemental. Il est également un magazine de qualité à la fois scientifique et accessible traitant de plusieurs sujets : des conseils photo aux récits d’expédition, en passant par des fiches biologiques sur les espèces communes et plus rares. En Profondeur, c'est la fenêtre qui s'ouvre sur cet univers des plus fascinants.